Eksoniliitäntäryhmän asettelu käyttää koettimia, jotka ovat spesifisiä geenin ennustettujen eksonien odotettavissa tai potentiaalisissa silmukointipaikoissa. Se on keskitiheydellä tai peitolla tyypilliseen ilmentymisryhmän geenimuotoon (jossa 1–3 koetinta per geeni) ja genomiselle laatoitusryhmälle (satoja tai tuhansia koettimia geeniä kohti). Sitä käytetään geenin vaihtoehtoisten silmukointimuotojen ilmentymismuodon määrittämiseen. Eksonimatriiseilla on samanlainen asettelu, jossa käytetään koettimia, jotka on suunniteltu kohtaamaan jokainen yksittäinen eksoni tunnetuille tai ennustetuille geeneille, ja niitä voidaan käyttää havaitsemaan samanlaisia silmukoivia isomuotoja.
Fuusiogeenien mikromatriisi
Fuusiogeeniä microarray voi kohdata fuusiotranskriptien, kuten syöpään yksilöitä. Tämän takana oleva periaate perustuu vaihtoehtoiseen liitokseseen microarrays. Oligonäyttelystrategia mahdollistaa chimeric -kopioistien liittymien yhdistetyt mittaukset yksittäisten fuusiopartnerien eksonmittaisilla mittauksilla.
Laatoitusryhmä
Genomimallilaatikot koostuvat päällekkäisistä koettimista, jotka on suunniteltu edustamaan tiheästi mielenkiintoista genomialuetta, joskus yhtä suuri kuin ihmisen koko kromosomi. Tavoitteena on kohdata empiirisesti transkriptien tai vaihtoehtoisesti silmukoitujen muotojen ilmaisumuoto, jota ei ehkä ole aikaisemmin tiedossa tai ennustettu.
Kuva 146A | Kaksi Affymetrix-sirua. Tulos näkyy vasemmassa alakulmassa koon vertailua varten. | Koneella luettavaa kirjailijaa ei toimitettu. Schutz oletti (perustuu tekijänoikeusvaatimuksiin). / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Affymetrix-microarray.jpg) Wikimedia Commonsista
Kirjailija : Milos Pawlowski
Kommentit
Lähetä kommentti