Väärin suuntautuneita jatko-osia on läsnä referenssigenoomeissa merkittävinä nopeuksina (esim. 1% hiiren referenssigenoomissa). Strand-seq voi tavanomaisten sekvensointimenetelmien avulla paljastaa nämä väärinkäytöt. Epäorientoituneita jatkoja esiintyy silloin, kun juosteen perimä muuttuu yhdestä homotsygoottisesta tilasta toiseen (esim. WW CC: hen tai CC WW: hen). Lisäksi tämä tilamuutos on näkyvissä jokaisessa Strand-seq-kirjastossa, mikä vahvistaa väärin suuntautuneen jatkumon olemassaoloa.
Sisarkromatidien satunnaisen segregaation tunnistaminen
Ennen 1960-luvua oletettiin, että sisarkromatidit erotettiin satunnaisesti tytärsoluiksi. Siitä huolimatta sisarkromatidien erillistä jakautumista on havaittu nisäkässoluissa siitä lähtien. Ei-satunnaisen segregaation selittämiseksi on esitetty muutamia hypoteeseja, mukaan lukien Kuolematon Strand -postulointi ja Hiljaisen sisar -postulolaatti, joista toinen voidaan toivottavasti todentaa Strand-seq-menetelmällä.
'' Kuolemattoman juosteen hypoteesi ''
Kuva 263A | BAIT: n lähtö, joka näyttää lukemat sekä Watson (W, vihreä) että Crick (C, sininen) juosteista. Jokainen lueteltu palkki osoittaa analyysien lukumäärän, joka on kohdistettu viitegenomin tiettyyn 200 kb: n biniiniin. Tästä päätellään vanhempien mallin juosteen periminen. Kuten, jos tytärsolun 200 kb: n kromosomaalisegmentin molemmat kopiot syntetisoidaan emäsolussa olevista Watson-templaattilangoista, tätä edustaa suuri vihreä palkki, joka osoittaa puhtaasti W-kohdistuksen kyseisessä kromosomaalisessa alueella. Samoin kytkentät templaas juosteen perinnöllisyyden homotsygoottisten ja heterotsygoottisten tilojen välillä tulkitaan sisarkromatidivaihteina (SCE). | Maia.seppä / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Bioinformatic_Analysis_of_Inherited_Templates_(BAIT)_Output.png) from Wikimedia Commons
Kirjailija : Yavor Mendel
Kommentit
Lähetä kommentti