Dynaamiset genomit, joilla on korkea plastiikkaus, ovat välttämättömiä, jotta patogeenit, enimmäkseen bakteerit, selviäisivät muuttuvissa ympäristöissä. Korkean suorituskyvyn sekvensointimenetelmien ja in silico-tekniikoiden avulla on mahdollista paljastaa, vertailla ja luetteloida monia näistä dynaamisista genomisista tapahtumista. Genominen monimuotoisuus on tärkeää patogeenin havaitsemisessa ja hoidossa, koska nämä tapahtumat voivat muuttaa patogeenin palvelua ja rakennetta. Taudinaiheuttajien mekanismien ymmärtämiseksi on tarpeen analysoida useampaa kuin yhtä patogeenilajin ketjuttamista. Vertaileva genomiikka on menetelmä, jonka avulla tutkijat voivat verrata erilaisten lajien ja kantojen genomeja. On olemassa useita esimerkkejä onnistuneista vertailevista genomitutkimuksista, muun muassa Listeria ja Escherichia coli. Jotkut tutkimukset ovat yrittäneet selvittää eroa patogeenisten ja ei-patogeenisten mikrobien välillä. Tämä tutkimus osoittautuu vaikeaksi, vaikkakin yhdellä bakteerilajilla voi olla useita kantoja ja näiden kantojen genomipitoisuus vaihtelee.
Kuva 383A | microarray siru sisältää täydentäviä DNA (cDNA), jolloin monet sekvenssit etua. CDNA fluoresoi, kun se hybridisoituu näytteessä olevan vastaavan DNA fragmentin kanssa. | Kansallinen syöpäinstituutti / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Microarray_Comparative_Genomic_Hybridisation.jpg) Wikimedia Commonsista
Kirjailija : Merim Kumars
Viitteet:
Lääketieteellinen mikrobiologia II: Sterilointi, laboratoriodiagnoosi ja immuunivaste
Kommentit
Lähetä kommentti